0x010088F6312065A70A44B630A6848498EAD80093CFEAFE161DC94D83C7C5C9A5A748B8

Assessment and action plan. Teaching roomThe room situation is still a big challenge in this course. Although the course coordinator asked to have rooms that fulfil our criteria, we were given rooms that were unsuitable for our kind of teaching, as well as a time schedule that was 75% wrong relative to our strong requests. More details about this situation can be found in the reference group's report. Paper readingThe students are now given information at the start of the course on how to efficiently read papers. R introduction sessionA brief introductory session on how to use R is now provided to students at the start of the course. This helps the students focus on biological understanding rather than technical aspects of using R.

The students and teachers agree that the curriculum and teaching quality in the course is very good and contributes nicely to students achieving the course's learning outcomes. The lectures are regarded as informative and of high quality. It is also highly appreciated that the course includes a varied and balanced mix of teaching activities that help the students learn: going through theory in lectures, discussions and dialogue about theory, methods, data, statistical analyses and interpretation of results (often from actual empirical papers), and practical analyses of empirical data sets to answer relevant and interesting biological questions. It is important that there are good teaching assistants in the course, because of its heavy dependency on student active learning activities that usually involve analyses of empirical data using R. The oral exam is a novel and stressful situation for most students, but seems to be the best way to evaluate the student learning in the course. The students appreciate the possibility to have 20-30 minutes to prepare some answers on beforehand, and the way the examiners are helping them explain what they have understood.

It is problematic for many students to have teaching sessions at 8 in the morning and after 16 in the afternoon (three out of our four weekly teaching sessions were at these hours this time, even though the course coordinator specifically requested no early or late teaching hours). Setting teaching sessions to after 16 should not be allowed, because students cannot enter many buildings or parts of buildings after this time of day. Furthermore, there should never be two teaching sessions in the same day, like we had this time.

NTNU:TIA:REST

Institutt for biologi

Department of Biology

Ingen trykte eller håndskrevne hjelpemidler tillatt. Bestemt, enkel kalkulator tillatt.

Engelsk

Mer om vurdering

Alle vurderingskomponentene inkludert i emnet må være bestått. Du kan ikke klage på karakterer i eksamener som på grunn av prøvens art ikke lar seg etterprøve - for eksempel muntlig eksamen. Ved tilfeller av «stryk» eller «gjentak», må den muntlige eksamenen tas på nytt.

Anbefalte forkunnskaper

Faglig innhold

Emnet omfatter flere aspekter knytta til evolusjonær og økologiske genetikk og fokuserer på casestudier og dataanalyser. Emnet legger vekt på koblinga mellom molekylære og fenotypiske analyser i studier av evolusjonære prosesser i naturlige populasjoner. Det fokuseres også på å koble evolusjonære og økologiske prosesser.Molekylær evolusjon:<ul><li>Populasjonsgenetikk</li><li>Landskapsgenetikk</li></ul>Fenotypisk evolusjon:<ul><li>Prinsipper for naturlig seleksjon og adaptiv evolusjon</li><li>Kvantitativ genetikk</li><li>Evolusjonær økologi</li></ul>Kobling av molekylær og fenotypisk evolusjon:casestudier<ul><li>Å bruke fylogeni: komparative metoder</li><li>Adaptasjon på genomnivå, genkartlegging, og populasjonsgenomikk</li></ul>

Kursmateriell

- Conner, J. K. &amp; Hartl, D. L. 2004. A Primer of Ecological Genetics. Oxford University Press (ISBN: 9780878932023).- Forelesningsnotater, kompendier, og ulike vitenskapelige publikasjoner.

Læringsutbytte

KunnskapStudenten skal kunne forklare:<ul><li>Underliggende genetiske mekanismer for evolusjonære prosesser</li><li>Generelle prinsipper i populasjonsgenetikk og kvantitativ genetikk -</li><li>Grunnleggende teorier for fenotypisk seleksjon og adaptiv evolusjon</li><li>Hvordan økologiske og evolusjonære prosesser gjensidig påvirker hverandre og populasjonsoverlevelse på kort og lang sikt.</li></ul>FerdigheterStudenten skal kunne:<ul><li>Bruke genetiske data til å estimere populasjonsgenetiske parametere og bestemme slektskap og individuell fitness</li><li>Estimere styrken og retningen på fenotypisk seleksjon og predikere evolusjonshastighet</li><li>Lese kritisk, tolke og vurdere resultater fra studer i skjæringspunktet mellom evolusjon, genetikk og økologi</li><li>Planlegge studier i evolusjonær og økologisk genetikk.</li></ul>Generell kompetanseStudenten skal kunne:<ul><li>Vurdere betydningen av genetiske og økologiske prosesser for evolusjon i naturlige populasjoner</li><li>Bedømme og reflektere over primærlitteratur i evolusjonær og økologisk genetikk</li><li>Lage en skriftlig og/eller muntlig presentasjon med resultater fra kvantitative studier</li><li>Bruke vitenskapelig metode til å besvare nøkkelspørsmål innen evolusjonær og økologisk genetikk.</li></ul>

Læringsformer og aktiviteter

Forelesninger (ca. 34 timer), seminarer, diskusjoner og øvinger/datalaber (ca. 32 timer). Undervisninga er i stor grad basert på aktive læringsaktiviteter som øvinger/datalaber der studentene analyserer data fra empiriske studier i evolusjonær og økologisk genetikk. Emnet inkluderer også skriving av rapport og/eller å lage og holde muntlige presentasjoner. Obligatoriske aktiviteter: Godkjente rapporter/øvinger.

Godkjent rapport

Evolusjonær og økologisk genetikk

Biologi

Natural Resources Management (Master's Programme)

Lektorutdanning i realfag for trinn 8 – 13

Biology (Master's Programme)

Web/Lists(guid'8b698a2d-6ad0-4f7d-b3be-219cc1979f02')/Items(18803)/FieldValuesAsText

- The teaching in the course starts relatively late in the semester, and it is then important that the students should be informed about the curriculum early to be able to use free time to read. 
- The lectures and learning activities should be tied better to the book by e.g. providing information on which part(s) of the book is relevant for different lecture/learning topics. 
- Papers for paper presentations and discussions should be given earlier to give students more time to prepare. 
- The colloquium sessions between the first lecture and the main teaching in the course should be better structured and organized. For example by providing pre-prepared questions for students to discuss. A possibility could be to use some of the questions at the end of chapters in the book for this. 
- It would be nice if answers to end-of-chapter questions could be provided on Blackboard. 
- During the semester various students in the course have been in corona-related quarantine, and a digital solution for participating in the teaching and learning activities should be provided for those students. 

Tiltak

Measures that may enhance the learning outcomes, as proposed by the reference group

To alleviate the problem that some students may have very little previous experience with R and may then often be “lost” in the exercises/assignments where R is used (so that the biological understanding the activities are supposed to give is sometimes reduced), we should give a brief introductory session on how to use R and RStudio at the start of the course. 

R introduction session

To help student learning when they read papers we should provide some information to the students at the start of the course on how to efficiently read papers.

Paper reading

The same room should be used in all teaching and learning sessions. The room should be organized such that there is a teacher/presenter screen, and power outlets should be available for all students because student laptops are used in each teaching session. If the room has group tables and one screen per group table (may be useful in some teaching sessions), there should also be a possibility for sharing the teacher/presenter screen on every group’s screen.

Teaching room

Teaching rooms should be suitable for our kind of student active learning.

There should not be two teaching sessions on the same day, teaching after 16 should not occur, and teaching before 9 should be avoided.

Teaching schedule

Some changes were done to the teaching based on last year's evaluation of the course. Students were given information about the curriculum, learning goals and learning activities in a teaching session early in September. They were then given discussion questions to work on in groups (with possibility to get help from a teaching assistant) until the main teaching period of the course. The curriculum literature, discussion papers and other useful reading for the main teaching period was also posted during that period. The curriculum book was changed since autumn 2020. Some students felt the book was a bit difficult to read while others found it gave a nice introduction/background to most topics covered in the course. The connections between different parts of the curriculum and what was covered in different teaching sessions was made clear. However, although curriculum papers and/or book chapters complement the curriculum book in a good way, the book is a bit old and we should consider finding a better and more updated book.

Overall, the learning environment in the course is very good. The topics of the lectures are well explained, there is a friendly and open atmosphere which means it is easy to ask questions and discuss, and the teachers are good at engaging students in the varied and mostly student-active learning activities which usually involves using R. Even if use of R is challenging to most students, there is a nice progression to how advanced the use of R in exercises/practicals is, ending with a practical where the students are relatively free to design their own study and analyse data to answer the questions they pose themselves, and where understanding and skills developed from the start of the course is used. The teaching and learning activities are very well aligned with the learning outcomes of the course, and the oral exam at the end of the course provides an appropriate way to assess the students learning relative to the learning goals. The oral exam is organized so that the students get 30 minutes to prepare their answer to a few selected questions, before they discuss these and other questions with the examiners. Most questions are focused on assessing the students ability to apply their understanding, skills and knowledge to answer relevant research questions.

The room situation of the course must be improved. First, the same room should be used in all teaching and learning sessions. Furthermore, the room should be organized such that there is a teacher/presenter screen, and power outlets should be available for all students because student laptops are used in each teaching session. If the room has group tables and one screen per group table (may be useful in some teaching sessions), there should also be a possibility for sharing the teacher/presenter screen on every group’s screen.

Alle vurderingskomponentene inkludert i emnet må være bestått. Du kan ikke klage på karakterer i eksamener som på grunn av prøvens art ikke lar seg etterprøve - for eksempel muntlig eksamen. Ved tilfeller av «stryk» eller «gjentak», må den muntlige eksamenen tas på nytt.

Emnet omfatter flere aspekter knytta til evolusjonær og økologiske genetikk og fokuserer på casestudier og dataanalyser. Emnet legger vekt på koblinga mellom molekylære og fenotypiske analyser i studier av evolusjonære prosesser i naturlige populasjoner. Det fokuseres også på å koble evolusjonære og økologiske prosesser.Molekylær evolusjon:<ul><li>Populasjonsgenetikk</li><li>Landskapsgenetikk</li></ul>Fenotypisk evolusjon:<ul><li>Prinsipper for naturlig seleksjon og adaptiv evolusjon</li><li>Kvantitativ genetikk</li><li>Evolusjonær økologi</li></ul>Kobling av molekylær og fenotypisk evolusjon:casestudier<ul><li>Å bruke fylogeni: komparative metoderr</li><li>Adaptasjon på genomnivå, genkartlegging, og populasjonsgenomikk</li></ul>

- Conner, J. K. &amp; Hartl, D. L. 2004. A Primer of Ecological Genetics. Oxford University Press (ISBN: 9780878932023).- Forelesningsnotater, kompendier, og ulike vitenskapelige publikasjoner.

Kunnskap. Studenten skal kunne forklare: - Underliggende genetiske mekanismer for evolusjonære prosesser - Generelle prinsipper i populasjonsgenetikk og kvantitativ genetikk - Grunnleggende teorier for fenotypisk seleksjon og adaptiv evolusjon - Hvordan økologiske og evolusjonære prosesser gjensidig påvirker hverandre og populasjonsoverlevelse på kort og lang sikt Ferdigheter. Studenten skal kunne: - Bruke genetiske data til å estimere populasjonsgenetiske parametere og bestemme slektskap og individuell fitness - Estimere styrken og retningen på fenotypisk seleksjon og predikere evolusjonshastighet - Lese kritisk, tolke og vurdere resultater fra studer i skjæringspunktet mellom evolusjon, genetikk og økologi - Planlegge studier i evolusjonær og økologisk genetikk Generell kompetanse. Studenten skal kunne: - Vurdere betydningen av genetiske og økologiske prosesser for evolusjon i naturlige populasjoner - Bedømme og reflektere over primærlitteratur i evolusjonær og økologisk genetikk - Lage en skriftlig og/eller muntlig presentasjon med resultater fra kvantitative studier - Bruke vitenskapelig metode til å besvare nøkkelspørsmål innen evolusjonær og økologisk genetikk

Lektorutdanning i realfag - masterstudium (5-årig)

Web/Lists(guid'8b698a2d-6ad0-4f7d-b3be-219cc1979f02')/Items(13247)/FieldValuesAsText

The course encompasses several aspects of evolutionary and ecological genetics focusing on case studies and data analysis. The course emphasizes the link between molecular and phenotypic analyses in the study of evolutionary processes in natural populations. A special focus is also made on linking evolutionary and ecological processes.Molecular evolution:<ul><li>Population genetics</li><li>Landscape genetics</li></ul>Phenotypic evolution:<ul><li>Principles of natural selection and adaptive evolution</li><li>Quantitative genetics</li><li>Evolutionary ecology</li></ul>Linking molecular and phenotypic evolution: case studies<ul><li>Applying phylogeny: comparative methods</li><li>Genomics of adaptation, gene mapping, and population genomics</li></ul>

Knowledge. The candidate should be able to explain: - Genetic mechanisms underlying evolutionary processes - General principles in population genetics and quantitative genetics - Basic theories of phenotypic selection and adaptive evolution - How ecological and evolutionary processes interact and affect short- and long-term population viability Skills. The candidate should be able to: - Use genetic data to estimate population genetic parameters and determine relatedness and individual fitness - Estimate strength and direction of phenotypic selection and predict rate of evolution - Analyze relatedness and molecular genetic data to determine the genetic basis for ecologically important phenotypic traits - Read critically, interpret and judge results from studies at the intersection of evolution, genetics and ecology - Plan studies in evolutionary and ecological genetics General competence. The candidate should be able to: - Evaluate the importance of genetic and ecological processes for evolution in natural populations - Judge and reflect on primary literature in evolutionary and ecological genetics - Generate a written and/or oral presentation of results from quantitative studies - Use the scientific method to answer key questions in evolutionary and ecological genetics.

Lectures (ca. 34 hours), seminars, discussions, and data-labs (ca. 32 hours). The teaching is to a high degree based on active learning activities such as exercises/data-labs where the student will analyze data from empirical studies in evolutionary and ecological genetics. The course also includes writing reports and/or preparing and giving oral presentations. Compulsory assignments: Approved reports/presentations.

Examination arrangement: Oral examinationGrade: Letters

Alle vurderingskomponentene inkludert i emnet må være bestått. De ulike komponentene vil ikke karaktersettes, men vurderinga består av én sluttkarakter. Søknad om gjentak gjelder kun for den muntlige eksamenen. Ved tilfeller av «stryk» eller «gjentak», må den muntlige eksamenen tas på nytt.

UTF §5-6 i utfyllende regler for realfagsstudiene ved NTNU regulerer gjentak av skriftlig og muntlig avsluttende eksamen i realfagsemner.

Eksamensspråk: Engelsk


Emnet omfatter flere aspekter knytta til evolusjonær og økologiske genetikk og fokuserer på casestudier og dataanalyser. Emnet legger vekt på koblinga mellom molekylære og fenotypiske analyser i studier av evolusjonære prosesser i naturlige populasjoner. Det fokuseres også på å koble evolusjonære og økologiske prosesser.

1 Molekylær evolusjon
- Populasjonsgenetikk
- Landskapsgenetikk

2 Fenotypisk evolusjon
- Prinsipper for naturlig seleksjon og adaptiv evolusjon
- Kvantitativ genetikk
- Evolusjonær økologi

3 Kobling av molekylær og fenotypisk evolusjon: casestudier
- Å bruke fylogeni: komparative metoderr
- Adaptasjon på genomnivå, genkartlegging, og populasjonsgenomikk


- Sætre, G.-P. & Ravinet, M. 2019. Evolutionary Genetics. Concepts, Analysis, and Practice. Oxford University Press (ISBN: 9780198830924).
- Forelesningsnotater, kompendier, og ulike vitenskapelige publikasjoner.


Forelesninger (ca. 34 timer), seminarer, diskusjoner og øvinger/datalaber (ca. 32 timer). Undervisninga er i stor grad basert på aktive læringsaktiviteter som øvinger/datalaber der studentene analyserer data fra empiriske studier i evolusjonær og økologisk genetikk. Emnet inkluderer også skriving av rapport og/eller å lage og holde muntlige presentasjoner.

Obligatoriske aktiviteter:
Godkjente rapporter/øvinger.


Kunnskap. Studenten skal kunne forklare:
- Underliggende genetiske mekanismer for evolusjonære prosesser
- Generelle prinsipper i populasjonsgenetikk og kvantitativ genetikk
- Grunnleggende teorier for fenotypisk seleksjon og adaptiv evolusjon
- Hvordan økologiske og evolusjonære prosesser gjensidig påvirker hverandre og populasjonsoverlevelse på kort og lang sikt

Ferdigheter. Studenten skal kunne:
- Bruke genetiske data til å estimere populasjonsgenetiske parametere og bestemme slektskap og individuell fitness
- Estimere styrken og retningen på fenotypisk seleksjon og predikere evolusjonshastighet
- Lese kritisk, tolke og vurdere resultater fra studer i skjæringspunktet mellom evolusjon, genetikk og økologi
- Planlegge studier i evolusjonær og økologisk genetikk

Generell kompetanse. Studenten skal kunne:
- Vurdere betydningen av genetiske og økologiske prosesser for evolusjon i naturlige populasjoner
- Bedømme og reflektere over primærlitteratur i evolusjonær og økologisk genetikk
- Lage en skriftlig og/eller muntlig presentasjon med resultater fra kvantitative studier
- Bruke vitenskapelig metode til å besvare nøkkelspørsmål innen evolusjonær og økologisk genetikk


Approved Reports/presentations

Web/Lists(guid'8b698a2d-6ad0-4f7d-b3be-219cc1979f02')/Items(7095)/FieldValuesAsText

Evolusjonær og økologisk genetikk - BI3083